资源的合理分配是确保避难所稳定运行的核心。电力、食物和水是三大基础资源，需优先保障其生产设施的建设与升级。电力资源支撑整个避难所的运转，若供应不足，部分房间将停止工作；食物短缺会导致居民掉血；水资源匮乏则会使居民受到辐射威胁。初期应集中资源建造发电室、餐厅和水处理室，并将居民分配到对应属性的岗位，例如高力量（S）居民适合发电站，高敏捷（A）居民适合餐厅，高感知（P）居民适合水处理厂。基础资源的生产效率需始终高于消耗速度，建议将资源槽维持在1/4至1/3避免因短缺引发连锁危机。
防御类建筑如升级后的避难所大门能有效抵御匪徒入侵，建议在第一层布置高战斗力居民并配备武器。人口扩张需谨慎，通过广播室吸引外来幸存者或安排居民生育增加劳动力，但需确保资源储备充足。生育过程中可将男性居民派往废土探索以腾出空间，返回后继续参与生产。探索废土的居民需携带治疗针和消辐宁，并优先选择综合属性较高者，以延长存活时间并获取更多装备。
后期资源分配需侧重设施优化与居民培养。合并同类型房间可提升生产效率，例如将三个发电室合并为大型发电厂。训练室用于提升居民属性，优先培养力量、敏捷和运气（L），前者直接关联生产效率，后者增加探索收益与加速模式成功率。医疗站和科学实验室需定期生产治疗针与消辐宁，以应对内部灾害和外部威胁。储藏室应集中建造在边缘区域，武器和装备尽量装备在居民身上，避免占用库存空间。
火灾、虫害或死爪袭击等事件可能同时消耗电力与医疗资源，因此需保持治疗针库存，并确保至少两层防御梯队。巧手先生机器人可自动收集资源，但需避免其参与战斗，因复活成本较高。灾害发生时，迅速将居民调至受灾房间，并通过点击人头手动加血。定期巡检设备状态，及时修复故障房间，防止问题蔓延。
最终目标是实现资源循环与可持续发展。通过合理规划楼层布局，将生产区置于中层，训练区靠近工作区以减少操作耗时。电力需求较高，可单独设置电力专用楼层。居民幸福度通过分配适配岗位、配备装备及激活极速模式提升，高幸福度能进一步提高生产效率。资源分配需动态调整，例如探索收益较多时可减少生产投入，转而升级防御或训练设施。长期规划需兼顾当前需求与未来扩展空间，避免因盲目扩张导致资源崩溃。
