影之刃3的主线剧情围绕武林阴谋与杀气改造技术展开，其中唐门叛徒唐礼的支线是最具深度的选择。这段剧情通过唐冰与唐礼的情感纠葛，揭示了扭曲爱恨如何被野心家利用，最终引发连环杀戮。剧情文本采用古龙式文风，将江湖恩怨与机关术设定融合，在追击唐礼的过程中逐步揭开十一人阁遗留的杀气改造秘密。该支线不仅交代了世界观核心冲突，其多结局设计也影响了后续组织与武林正道的关系走向。
黑白正道章节作为第四章主线，同样是不可忽视的优质剧情。该篇章以坠星原为舞台，通过藏剑宫邵氏父子的悲剧，探讨了传统武林门派在新技术冲击下的困境。剧情中出现的龙氏家族令牌与掌令者标志，直接关联游戏核心谜团。相较于其他线性叙事章节，该部分采用多视角闪回手法，使邵玄雕兄弟的回忆与现实调查交织，增强了悬疑感。玩家在此章节的选择会影响最终对武林正道联盟的评判。
支线任务童心难存和善恶有报虽体量较小，但叙事完整性突出。童心难存通过落鸦村妞妞的遭遇展现平民在武林争斗中的处境，任务中善意隐瞒的选项设计体现了道德困境。善恶有报则采用环形叙事结构，从购买手镯到揭穿阴谋共包含五个阶段，最终在金光岭的抉择会影响角色声望值。这两条支线都完美融入了主线世界观，且奖励包含实用装备改造资源。
木沉支线的价值在于其多重奖励机制与剧情深度平衡。该支线包含十二个关键选择节点，每次对话选项都关联不同品质的面具奖励。给十万铜币换取银面具的选项虽消耗资源较多，但会解锁后续隐藏剧情。支线中关于忍者传承的探讨，补充了游戏中东瀛势力与中原武林的互动背景。战斗环节设计的守护者BOSS战，需要玩家灵活运用环境机关，这种玩法与叙事的结合颇具匠心。
